1. 前期准备阶段（建账与制度规范）

建立研发费用辅助账

政策依据：根据《高新技术企业认定管理办法》，需单独核算研发费用，区分 “研发活动” 与 “生产经营活动” 支出。

辅助账内容：按《企业会计准则》设置 8 大类研发费用（人员人工、直接投入、折旧摊销、设计费用、装备调试费、委托外部研发费、其他费用、无形资产摊销），逐笔记录并标注对应研发项目（如 “项目 A - 软件研发”）。

工具建议：使用财务软件（如用友、金蝶）的 “项目辅助核算” 功能，或下载《研发费用辅助账样式》（国家税务总局公告 2021 年第 28 号附件）模板。

制定研发费用管理制度

明确研发项目立项、费用审批、报销流程，确保研发活动与账务记录一一对应（如立项文件、研发合同需存档备查）。

2. 日常账务核算（核心环节）

研发费用归集与分类

3. 专项审计与税务处理

专项审计报告

时间节点：每年汇算清缴前，委托具备资质的中介机构（需在 “高新技术企业认定管理工作网” 备案）出具 《研发费用专项审计报告》 和 《高新技术产品（服务）收入专项审计报告》。

核心数据：

研发费用占比：近三年研发费用 / 销售收入需符合比例（如年销售收入＜5000 万元，占比≥5%）。

高新技术产品收入占比：需≥60%（收入需与知识产权直接相关，如专利对应的产品销售合同）。

税务申报与优惠享受

加计扣除：在企业所得税汇算清缴时，按研发费用的 100% 加计扣除（制造业企业）或 75%（其他企业），需填报《研发费用加计扣除优惠明细表》（A107012）。

数据一致性：专项审计数据需与税务申报表（增值税、企业所得税）一致，差异超过 5% 需提供《差异说明》（如研发费用辅助账与纳税申报表的勾稽关系）。

4. 后续管理与风险控制

资料存档

保存期：研发费用辅助账、专项审计报告、立项文件等资料需保存 10 年（税务检查要求）。

电子存档：部分地区（如广州）要求上传研发费用辅助账电子版至 “高企认定管理系统”。

应对核查

税务稽查：重点核查研发人员社保、委托研发合同真实性、费用分摊合理性（如共用设备分摊比例是否有依据）。

高企复核：如企业被抽中现场核查，需提供研发设备清单、原材料出入库记录、产学研合作协议等原始凭证。